Mi temp thérapeutique et grossesse

Bonjour, j’ai une reconnaissance de travailleur handicapé,et je suis à actuellement enceinte de 5 mois, après avoir consulter la médecine du travail et mon médecin traitant on m’a préconisé de faire une demande de mi temp thérapeutique non pas en lien avec la grossesse. Douleur déjà présente du à mon handicap mais aggravé par la grossesse.
Mon employeur a accepter le mi temp thérapeutique et j’ai repris aujourd’hui. La convention collective prévoit une réduction du temp de travail journalier de 30min pour les salariées enceinte.
Il me semble que la médecine du travail ma dit que cette réduction du temp de travail sera applicable au mi temp thérapeutique
Cependant mon manager m’a dit que je n’y avait plus droit puisque j’ai déjà un mi temp thérapeutique.
Je ne comprend pas puisqu’il me semble que les conventions collectives sont applicable à tous les salariés de l’entreprise peu importe le type de contrat de travail.
Pouvez vous m’éclairer ?

Merci
Ps: je suis coiffeuse